Biomek+Echo: 高通量、低成本NGS建库的秘诀

在过去十多年里，随着二代测序技术的发展，测序成本已经下降了几个数量级，但是二代测序样品文库制备成本仍然高昂，过程依旧复杂。微生物及病毒全基因组测序能帮助科学家们确认基因组编辑正确性，解析病原的变异及进化，是高通量基因编辑和调查微生物组、病毒学研究的常规工作。液体处理专家贝克曼库尔特创新推出Biomek i5+Echo 525超高通量自动化整合系统，帮助您实现二代测序文库构建中的高通量和低成本的需求。

图1. Biomek i5 +Echo 525整合系统。通过将Echo 525快速、精|确的声波移液技术与Biomek i系列工作站强大而灵活的功能相结合，可以将文库制备工作提高到超高通量。

我们使用illumina Nextera XT DNA试剂盒，以3种不同的微生物样品类型（蜡状芽孢杆菌，大肠埃希氏菌，红球菌）进行实验，测试了该微量化方法的有效性。Biomek i5+Echo 525 整合系统的微量化文库制备方案可将反应体系缩小20倍，降低每次反应的试剂成本；可单次处理384个样品，提高样品处理通量。 值得注意的是，根据Illumina的标准推荐实验流程，手工操作8个样品的时间约为3小时。利用Biomek i5 +Echo 525整合系统，完成384个样品的文库制备仅需4小时，该时间包括了试剂分装和孵育。试剂分装利用选择性吸头移液功能，可处理灵活多变的样品数量。微量化文库制备使更高的通量成为可能，而无需大幅增加时间。

图2. 微量化Illumina Nextera XT文库制备的自动化流程。灰色代表Biomek i5完成步骤，蓝色代表Echo 525完成步骤，红色代表手工干预步骤。Echo用于反应体系构建及Normalization/pooling；Biomek配置384通道加样器，并具有选择性吸头移液功能，用于分装Echo所需试剂并进行产物纯化；可选配台面整合的PCR仪，用于PCR扩增和孵育，减少人为干预。

图3.向导式的软件操作界面（左），和台面自动校对功能 (右)。如左图所示，在软件操作界面上用户可以选择样本数量，是否使用台面整合的PCR仪，以及运行工作流程的哪个部分。具备台面自动校对功能（右图），当操作人员完成耗材摆放后，工作站可自动判定耗材摆放是否正确，对错误摆放位置进行提示，确保程序运行前台面摆放正确。避免由于人为摆放耗材错误，导致设备碰撞或试剂、时间损失。

Better together—— Echo + Biomek自动化NGS建库方案：

   文库构建体系缩小20倍相应降低了试剂成本，无需吸头的纳升级声波介导移液节省了耗材成本。

   单次384个样品的处理，在单位时间内实现了超高通量的样本处理。

   精|准的纳升级至微升级移液技术及自动化处理，是获得真实结果的保障。

   向导式软件操作界面和台面自动校对功能可减少人为操作失误。

   强大的数据追踪系统能实现样本溯源及追踪，保证数据对接准确性。

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